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Laboratoire - Ingénieur en biologie médicale
Chargé de mission Développement de la Plateforme génomique AP-HP F/H
Titulaire ou CDI
Oui
Le département médico-technique recouvre les activités d’imagerie médicale, de biologie et d’anatomo-cyto-pathologie. Ces disciplines jouent un rôle clé dans l’offre de soins de l’AP-HP.
Elles recueillent les demandes de l’ensemble des autres services cliniques de l’hôpital. Le volume d’activité concerné est majeur, compte tenu des indications croissantes, avec un enjeu clé de délais d’accès aux examens pour les patients déterminants dans le diagnostic et la suite de leur prise en charge à l’hôpital.
Elles mobilisent des équipements à forte valeur ajoutée, objets d’innovations régulières et d’investissement conséquent pour renouveler le parc. Elles sont au cœur du développement de nouvelles organisations, appuyées notamment sur la numérisation des images et l’émergence croissante de solutions d’intelligence artificielle, notamment d’aide au diagnostic en imagerie ou en anatomo-cytopathologie.
Le département contribue à la définition de la stratégie permettant le positionnement optimal de ces activités au sein de l’offre de soins de l’AP-HP, dans un objectif d’amélioration continue du service rendu au patient. Les actions du département visent à améliorer la performance de nos organisations collectives, de sorte à maîtriser les délais d’accès aux examens et de rendus des résultats, en particulier ceux urgents, et contribuer ainsi à la qualité globale de la prise en charge du patient.
Le/la chargé(e) de mission « plateforme de séquençage très haut débit » intervient à un moment crucial de la structuration de la médecine génomique à l’AP-HP : les recommandations issues d’une mission menée par le Pr Xavier Jeunemaître sont en cours de mise en œuvre et particulièrement la construction d’une plateforme de séquençage génétique centralisée et mutualisée.
La mission principale du poste est de superviser la production d’une plateforme de médecine génomique, aussi bien en long read qu’en short read, en garantissant le processus de production d’un point de vue technique et organisationnel. L’échéance de démarrage de la production de la plateforme est positionnée au dernier trimestre 2026.
Le poste comporte donc prioritairement un volet pratique avec le démarrage de la production des examens sur la plateforme, et l’encadrement des équipes chargées des opérations techniques de laboratoire. Plus particulièrement, le/la chargé(e) de mission « plateforme de séquençage très haut débit » aura comme projets prioritaires en 2026 la mise en production d’un séquenceur Long read (PacBio Revio), la participation à un appel d’offres en vue d’acquérir un séquenceur Short read de très grande capacité et l’intégration progressive des activités de la plateforme LiBip, plateforme dédiée à la biopsie liquide sur ADN tumoral circulant labellisée Carnot.
L’essentiel des missions se fera sous la direction conjointe de la direction opérationnelle du Programme Médecine Génomique APHP et du service SMG-MSO auquel la plateforme est rattachée. Les interactions avec les hôpitaux et la communauté médicale sont au cœur de l’action du département. Le poste implique des déplacements sur les différents sites hospitaliers.
Compétences scientifiques et techniques :Expertise en génétique médicale et biologie moléculaire.Bonne connaissance des technologies de séquençage short read et long read.Compréhension des enjeux préanalytiques (ie. fonctionnement des automates type Hamilton ou Tecan), analytiques et post-analytiques (bioinformatique).Expérience pratique en préparation de librairies :Familiarité avec les cadres nationaux (PFMG, PNMR4, plan Cancer).Compétences transversales : Aptitude à travailler en interface entre cliniciens, biologistes et directions.Compétences en conduite de projets complexes.Expertise qualité.Encadrement d’équipe.
Jour
Administratif - Forfait
Une procédure d’intégration avec dispositif de tutorat et parcours de formation adapté.
Un accès aux formations internes (formations métiers, management…).
19 jours de RTT, en plus des 25 jours de congés.
TL possible en fonction de la mission.
75 % du NAVIGO remboursé.
Accès aux activités sociales et culturelles de l’AGOSPAP (sorties culturelles, voyages, centres de loisirs …) et aux réductions de HOPTISOINS.
Pour les enfants, crèches internes et possibilité de bénéficier du supplément familial de traitement.
France, Ile-de-France, Paris (75)
Paris 12
Siège de l'AP-HP
Direction de la Stratégie et de la transformation / Département médico-technique