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Recherche et recherche clinique - Ingénieur - Etudes - Données en recherche clinique
Ingénieur - Etudes - Données en recherche clinique F/H
CDD uniquement
Oui
InovAND, centre d’excellence dans le domaine des troubles du neuro-développement réunit en Île-de-France des équipes cliniques et scientifiques ainsi que les associations de familles et de patients, afin d’assurer un meilleur continuum entre expertise diagnostique et thérapeutique, de développer la recherche appliquée en santé et fondamentale, et de renforcer la formation universitaire sur les troubles du neuro-développement. Ce centre, coordonné par le Pr Richard Delorme (Service de psychiatrie de l’enfant et de l’adolescent, hôpital Robert-Debré, AP-HP), s’intègre plus globalement dans la dynamique de l’Institut Robert Debré du Cerveau de l’Enfant.
Le centre d’excellence InoVAND regroupe plus d’une trentaine qu’équipes cliniques et scientifiques, mais aussi des associations. • Il est piloté par le service de psychiatrie de l’enfant et de l’adolescent composé d’1 Chef de service, 12 PH, 2 CCA, 9 internes, ainsi que du personnel non médical (psychologues, orthophonistes, IDE, Logisticien, …)• L’objectif du centre InoVAND est de promouvoir la recherche, et la clinique pour offrir des soins d’excellence en partenariat avec un réseau d’associations.
L’ingénieur de recherche sera en charge de la collecte des données brutes multimodales : imagerie par résonance magnétique (IRM), électroencéphalographie à haute résolution (EEGHR) et basse résolution (EEG-LR), puces ADN, données cliniques, dans le cadre de la recherche sur les troubles du neuro-développement.• Collecter ces données pour les unités du service de pédopsychiatrie sur l’espace de stockage NAS mis en place au sein de l’hôpital, en améliorant les procédures de collectes déjà en place avec les différents techniciens.• Organisation de la base de données et mise à disposition des données uniformisées pour analyses.• Réalisation d’une interface utilisateur permettant d’accéder à l’ensemble des examens réalisés par chaque sujet de manière centralisée, ainsi que d’un outil de recherche (JavaScript, MongoDB)• Poursuite du travail de prétraitement des données multimodales, notamment d’anonymisation des données mis en place afin d’identifier chaque sujet par un master code unique. Conservation sécurisée de la correspondance sur serveur interne. • Suivi ponctuel des différents protocoles de recherche pour lesquels l’hôpital est centre d’inclusion, acquisition des données, formatage et livraison au PI selon les exigences de chaque projet.Activités principales• S’assurer de la bonne collecte des données dans chaque service selon la méthode et le logiciel spécifique• Mettre en place et maintenir des bases de données anonymisées d’imagerie clinique et automatiser le flux de données pour une visualisation et une utilisation optimale des images IRM et des enregistrements EEGActivités associées• Organiser/Participer à la maintenance et à l’évolution de l’environnement informatique du laboratoire• Participer activement à la valorisation scientifique des projets de recherche• Participer à la vie de laboratoire
Expertise avancée en gestion de données et programmation informatique (environnement UNIX, Python, Matlab, shell scripting, JavaScript)• Développement Web (Vue.js, MongoDB, HTML/CSS)• Connaissances en IRM cérébrales et EEG• Maitrise de l'anglais souhaitableSavoirfaire• Savoir organiser une base de données• Savoir manipuler des images IRM et des enregistrements EEG-HR et EEG-LR• Savoir adapter et développer des pipelines de traitements et d'analyses de données en vue de leur utilisation pour la population pédiatrique • Savoir faire le lien vers des utilisateurs non-experts• Savoir gérer les priorités et les contraintes• Savoir interagir avec des personnes de multiples expertises (cliniciens, chercheurs, informaticiens)Aptitudes • Aptitudes organisationnelles• Autonomie Dynamisme Rigueur• Capacité à organiser/animer un groupe de support • Pédagogie• Capacité à rendre compte• Bon relationnelSpécificité(s) / Contraintes du poste• Veiller à la gestion, cohérence et exhaustivité des banques de données IRM et EEG avec les données cliniques recueillies sur un logiciel hébergé par le serveur de l'hôpital• Faire le lien le cas échéant avec les techniciens et cliniciens impliqués dans le recueil des données• Réaliser des déplacements sur différents laboratoires en Ile de France (Institut Pasteur, NeuroSpin CEA Saclay, …) de manière ponctuelle • Respect de la confidentialité des informationsExpériences souhaitées• Expérience confirmée en gestion de base de données, et/ou en développement et évaluation d'outils de traitement et d'analyse d'images• Expérience en imagerie biomédicaleDiplôme(s) souhaité(s• École d'ingénieur, master 2 (BAC +5)• Doctorat en physique / imagerie médicale / traitement d'images
Travail de semaine en 7h30 par jour
Jour
7h30
France, Ile-de-France, Paris (75)
Paris 19
Hôpital Robert-Debré - Paris 19 (GHU Nord)
InovAND