Informations générales
Entité de rattachement du publieur
L'Assistance publique-Hôpitaux de Paris (AP-HP) est un centre hospitalier universitaire à dimension européenne mondialement reconnu.
Ses 38 hôpitaux accueillent chaque année 10 millions de personnes malades : en consultation, en urgence, lors d'hospitalisations programmées ou en hospitalisation à domicile.
Elle assure un service public de santé pour tous, 24h/24, et c'est pour elle à la fois un devoir et une fierté.
L'AP-HP est le premier employeur d'Ile-de-France : 100 000 personnes – médecins, chercheurs, paramédicaux, personnels administratifs et ouvriers – y travaillent.
Au cœur de l'Institution, le Siège de l'AP-HP rassemble sous un même périmètre les directions fonctionnelles et les établissements qui lui sont rattachés :
CFDC (Centres de Formation et de Développement des Compétences), ACHAT (Achat Centraux Hôteliers Alimentaires et Techniques),
DRCI (Département de la Recherche Clinique et de l'Innovation) et DSN (Direction des Services numériques).
Avec ses 4000 collaborateurs, le Siège assure un rôle d'expert, de pilote et de coordinateur pour l'ensemble des hôpitaux.
Engagée dans des projets novateurs et stratégiques au service des patients, l'AP-HP recherche aujourd'hui de nouveaux talents pour mener à bien sa mission.
Vous êtes l'un d'eux ? Venez nous rejoindre !
Date de parution
18/11/2024
Description du poste
Métier
Coordination et administration paramédicale - Gestion médico-administrative, traitement - analyse de l'information médicale
Intitulé du poste
Data Scientist F/H
Type de contrat
Titulaire ou CDD
Télétravail
Oui
Présentation du service
L’AP-HP est un centre hospitalier universitaire CHU, qui s’organise en 6 GHU et 38 hôpitaux, traitant 8 millions de patients annuellement dans divers domaines médicaux. En tant que premier employeur d’Île-de-France, elle compte près de 100 000 professionnels. Elle assure un service de santé public 24/24. Pour en savoir plus : http://www.aphp.fr
La Direction des Services Numériques (DSN) de l’AP-HP fournit des services numériques aux patients et aux professionnels, dont le dossier patient, des systèmes pour la biologie et l’imagerie, et une offre bureautique sur plus de 70 000 postes. Elle fournit également des services pour la réutilisation secondaire des données de santé, au service du pilotage, de la recherche et de l’innovation, au travers de son entrepôt de données de santé.
L’équipe BNDMR a en charge deux projets majeurs :
- BaMaRa : un site web permettant le recueil des données de santé au travers d’une IHM web. Des connecteurs sont en place pour intégrer au fil de l’eau les données provenant des systèmes d’informations d’hôpitaux autres que l’APHP. Il s’agit d’un développement en continu assuré par une équipe de 8 personnes.
- L’entrepôt de données de santé BNDMR : une infrastructure logicielle composée de plusieurs outils donnant accès aux données de soins provenant de BaMaRa, une fois les traits d’identités retirés. Cet environnement est utilisé par une équipe de data scientists en interne, avec de manière ponctuelle des intervenants externes.
Vos missions
Dans le contexte d’une forte augmentation des demandes d’exploitation des données de la BNDMR, des accès permanents au Système National des Données de Santé (SNDS) et au Programme de médicalisation des systèmes d’information (PMSI national), et de la perspective d’appariement de cette base aux données de l’Assurance Maladie (SNDS), La BNDMR cherche à renforcer son équipe data afin de :
- Harmoniser et d’industrialiser ses process de préparation et d’exploitation des données de la BNDMR à des fins d’analyses statistiques ;
- Renforcer ses capacités à répondre aux projets et demandes d’analyse émanant des différents partenaires ; et
- Développer une cellule d’expertise sur les données du SNDS et du PMSI pour les maladies rares.
Ainsi, nous recherchons un.e data scientist/ingénieur statisticien avec une compétence et une expérience avérée en en traitement de données pour assurer les missions suivantes :
- Participer à l’amélioration continue des scripts d’extraction, de préparation et de transformation des données de la BNDMR pour les analyses statistiques ;
- Produire des statistiques descriptives et restituer des résultats sous forme graphique ;
- Participer à l’élaboration des protocoles d’études et aux choix méthodologiques (design, objectifs, critère de jugement, population d’étude, plan d’analyse statistique…). ;
- Réaliser des analyses statistiques en lien avec des projets internes ou en partenariat avec des laboratoires publics/privés ;
- Réaliser des analyses statistiques sur des bases de données complexes auxquelles la BNDMR sera appariée (SNDS, EDS, PMSI) ; et
- Valoriser les résultats en contribuant à des publications scientifiques, posters et abstracts.
Profil recherché
SAVOIR FAIRE REQUIS
- Maîtrise indispensable des outils d'analyse de données (R et/ou Python) ;
- Maîtrise indispensable des systèmes de gestion des bases de données relationnelles (SGBDR PostgreSQL) ;
- Expérience avérée du travail collaboratif et reproductible (Gitlab) ;
- Expérience avérée en techniques de data management (manipulation de plusieurs sources, chainage, typage automatique des variables, gestion des libellés, bibliothèque de formats, sous-populations, gestion des données manquantes …) ;
- Expérience avérée en méthodes statistiques appliquées aux sciences de la vie (descriptives, univariées, multivariées, régression linéaire, régression logistique, modèles de survie, …) ;
- Expérience avérée dans la manipulation des données afin de repérer des évènements dans des grands volumes de data, des séries temporelles et si possible, dans un environnement de données de santé ;
- Connaissance des méthodes statistiques multivariées : PCA, PLS/PLS multi bloc, analyse longitudinale, analyse canonique généralisée, méthode de sélection des variables (lasso, réseau élastique, importance de la variable en projection) ;
- Maîtrise des méthodes d'apprentissage automatique (Random Forest, Naive Bayes Classifier, SVM…) serait un plus ;
- La connaissance des bases de données du SNDS (SNIIRAM, PMSI, EGB …) serait un plus ;
- Intérêt pour les études épidémiologiques ;
CONNAISSANCES ASSOCIEES
- Sensibilité aux pratiques régies par le RGPD et des orientations et doctrines CNIL sur la protection des données de santé ; et
- Bon niveau d'anglais (oral et écrit).
PRE-REQUIS
- Master ou PhD en science des données ou biostatistiques, ingénieur
Horaires de travail
25 jours de congés et 19 jours de RTT
Localisation du poste
Localisation du poste
France, Ile-de-France, Paris (75)
Ville
Paris 12
Hôpital et/ou site
Direction des Services Numériques