Informations générales
Entité de rattachement du publieur
Situé à Paris (10è arrondissement), l'hôpital Saint-Louis est reconnu au plan national et international en hématologie, dermatologie, cancérologie, infectiologie ainsi que dans le domaine des greffes d'organe et de moelle osseuse. Il possède également une expertise de haut niveau en chirurgie digestive, urologique et plastique. Il assure la prise en charge des grands brûlés en qualité de centre de recours régional.
Date de parution
26/11/2024
Description du poste
Métier
Laboratoire - Ingénieur en biologie médicale
Intitulé du poste
Ingénieur en bioinformatique au laboratoire d'Hématologie moléculaire et Biobanque F/H
Type de contrat
Titulaire ou CDD
Télétravail
Non
Présentation du service
Présentation de l’activité :
L’hôpital Saint-Louis et son Institut Hospitalo-Universitaire THEMA « Centre National de Médecine de Précision sur les Leucémies » est le premier centre européen pour les hémopathies malignes (https://irsl.u-paris.fr/thema). Le laboratoire d’Hématologie occupe une place centrale dans le diagnostic et le suivi des patients, ainsi que dans la recherche clinique et translationnelle sur les maladies du sang.
Le laboratoire d’hématologie est à l’interface entre le soin et la recherche. En effet, les analyses cellulaires et moléculaires permettant de caractériser les leucémies et les syndromes pré-leucémiques, de rechercher des prédispositions génétiques à ces maladies et d’évaluer la réponse au traitement. De plus, le laboratoire continue de développer des approches innovantes d’analyse génomique et mener des travaux de recherche translationnels sur des échantillons de patients afin de progresser dans la compréhension et le traitement de ces maladies.
Présentation du service :
Cytologie spécialisée
Immunophénotypage
Cytogénétique
Hématologie moléculaire et biobanque
Contrat à durée déterminée d'1 an, possibilité de renouvellement/titularisation.
Personnel médical:
Pr E. Clappier
Dr M. Duchmann, Dr R Kim
Dr M. Passet, Dr L. Chat
Chef de service Pr J. Soulier
Personnel non médical:
2 cadres médico-techniques
5 ingénieurs
36 techniciens
1 secrétaire
2 agents de réception/logistique
Vos missions
Missions Générales :
Contribuer aux activités de soin et de recherche translationnelle du laboratoire en participant à l’archivage des données brutes générées par les différents secteurs, au développement de pipeline d’analyse et à la structuration des résultats dans des bases de données interopérables pour les biologistes du laboratoire d’hématologie et la recherche.
Missions détaillées :
- Participer à l’archivage des données générées par le laboratoire (par exemple : données de cytométrie en flux, données de séquençage).
- Développer et maintenir des pipelines d’analyse de données générées par le laboratoire (par exemple : données de séquençage capture, données de RNA-seq) et travailler en collaboration avec la plateforme de bio-informatique de l’APHP MOABI.
- Former les ingénieur.es et technicien.nes du laboratoire au lancement de ces analyses.
- Rédiger des protocoles d’utilisation des outils développés et de la gestion documentaire relative à la qualité.
- Participer à la mise en place d’une base de données interopérable des résultats des données de soins générées par le laboratoire pour permettre leur utilisation par les biologistes du laboratoire.
Profil recherché
Profil :
Niveau I (BAC+4/+5)
Avoir des connaissances approfondies, théoriques et pratiques, en analyses courantes bio-informatique en génomique et dans la gestion de bases de données.
Expérience professionnelle souhaitée dans le milieu hospitalier ou la recherche en biologie
Compétences/savoir-faire requis :
- Bonne maitrise des langages de programmation R, Python, Bash
- Utilisation de gestionnaires de workflow (Snakemake, Nextflow)
- Utilisation des systèmes d'exploitation Linux et de la compilation de logiciels
- Expérience dans les principales analyses bio-informatique en santé (variant calling, RNA-seq)
- Expérience dans la gestion de bases de données
Connaissances requises :
- Connaissances générales en médecine et en biologie, en particulier en génomique
- Connaissances générales en statistiques
- Maîtrise de l'anglais écrit
Qualités professionnelles requises :
- Grande rigueur dans le traitement des données
- Capacité d'organisation et d'initiative
- Apprécier le travail en équipe
- Motivation et dynamisme apprendre et développer de nouvelles compétences
Horaires de travail
7h30/jour du lundi au vendredi entre 8h00 et 18h00
Les avantages de l'AP-HP
Vos avantages à l'AP-HP
AVANTAGES LIÉS AU STATUT ET A LA FONCTION
- Prime d'engagement collectif : 200 euros bruts / an, versement conditionné par la participation à un projet de service
- Supplément Familial de traitement pour les parents avec enfant(s) à charge
- Accès à une offre de formation continue conséquente
de logements à tarifs préférentiels dans le parc AP-HP pour les titulaires
AVANTAGES SOCIAUX
- Remboursement partiel des transports en commun ou forfait mobilité
- Possibilité de parking et de place en crèche
- Accès au restaurant du personnel à tarifs avantageux
- Plateforme HOPTISOINS : tarifs préférentiels chez nos partenaires (vie quotidienne, courses...)
- Chèques emploi-service CESU AP-HP
Localisation du poste
Localisation du poste
France, Ile-de-France, Paris (75)
Ville
Paris 10
Hôpital et/ou site
Hôpital Saint-Louis - Paris 10 (GHU Nord)
Service d'affectation
Laboratoire d'Hématologie Biologique