L’AP-HP est un centre hospitalier universitaire (CHU), qui s’organise en 6 GHU et 38 hôpitaux, traitant 8 millions de patients annuellement dans divers domaines médicaux. En tant que premier employeur d’Île-de-France, elle compte près de 100 000 professionnels. Elle assure un service de santé public 24/24. Pour en savoir plus : http://www.aphp.fr 

La Direction des Services Numériques (DSN) de l’AP-HP fournit des services numériques sécurisés aux professionnels et patients. Elle développe et gère plusieurs centaines de solutions, dont le dossier patient, la biologie, l’imagerie, l’espace patient et la gestion hospitalière, sur 70 000 postes. Elle administre ses infrastructures (réseau, data centers, téléphonie, wifi) et favorise la réutilisation des données de santé. Avec plus de 500 professionnels et un budget annuel de 204 M€, elle pilote 300 projets et recrute 100 professionnels par an.

Zoom sur les données et l’EDS !

Les données collectées dans le cadre de la prise en charge des patients, au travers du dossier patient informatisé, offrent la possibilité de constituer des bases de données pseudonymisées de très grandes dimensions et ouvrent des perspectives nombreuses pour la recherche appliquée en santé, mais également l’innovation et le pilotage de l’activité hospitalière. 

L’AP-HP a été parmi les pionniers dans le domaine en constituant le premier entrepôt des données de santé (EDS) hospitalier autorisé par la CNIL en 2017 et aujourd’hui le plus grand en Europe.

Au sein de l’équipe data science, vous aurez pour mission de développer, valider et maintenir des algorithmes et bibliothèques logicielles scientifiques facilitant l’exploitation des données de l’entrepôt de données de santé. Vous vous concentrerez en particulier sur les outils de traitement automatique du langage permettant de transformer les données non structurées textuelles de l’EDS en données structurées directement exploitables. Vous vous appuierez pour cela sur les nombreux projets de recherche et de pilotage déjà engagés sur l’EDS avec qui vous consoliderez leur expression de besoins ainsi que sur les premiers développements réalisés par l’équipe science des données. Les développements que vous réaliserez seront diffusés au sein de la communauté de recherche de l’AP-HP afin d’être utilisés par les chercheurs pouvant en bénéficier.

Vos missions consisteront à développer et maintenir des bibliothèques scientifiques adaptées au contexte spécifique de l’EDS (en particulier les projets EDS-PDF). Vous pourrez être amené.e à contribuer à des articles scientifiques valorisant d’un point de vue académique ces différents travaux. 

L’objectif principal de l’apprentissage est le développement d’une extension de la bibliothèque EDS-PDF. Cette bibliothèque vise à extraire le contenu textuel pertinent des comptes rendus médicaux stockés au format pdf. L’extension visera notamment à mieux intégrer les formulaires et les documents scannés. Des méthodes d’apprentissage profond (deep learning) et d’analyse de données massives (big data) devront être mobilisées pour mener à bien vos missions. Vous pourrez être amené.e à consolider un corpus d’entraînement et de validation. D’autres missions du périmètre de l’équipe pourront être confiées à l’apprentis en fonction de son avancement et de sa capacité à produire. Une attention particulière sera donnée à la qualité du code, au respect des bonnes pratiques collaboratives et à la capacité à communiquer sur les travaux réalisés. 

Missions principales :

- Développement, validation et maintenance de bibliothèques logicielles scientifiques écrites en Python facilitant l’intégration et l’exploitation des données de l’EDS ;

- Développement de modèles de machine learning (ML) pour pré-traiter les données ;

- Rédaction des documentations (technique et utilisateur) ;

- Revue de littérature scientifique et présentation de travaux de l’état de l’art ;

Un accès au self au 1er niveau de prix
Une prise en charge du titre de transport à 75% et/ou du versement d’une indemnité dans le cadre du forfait mobilités durables
Une offre de sorties culturelles,des réductions et des bons plans (HOPTISOINS)